Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL12Q9NXK8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FBXL12Q9NXK8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms