Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms