Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms