Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DCAF13Q9NV06 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCAF13Q9NV06 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCAF13Q9NV06 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCAF13Q9NV06 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCAF13Q9NV06 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCAF13Q9NV06 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCAF13Q9NV06 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCAF13Q9NV06 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCAF13Q9NV06 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms