Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBNL3Q9NUK0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBNL3Q9NUK0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBNL3Q9NUK0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBNL3Q9NUK0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms