Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms