Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms