Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSPNQ9HAW4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLSPNQ9HAW4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms