Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRDM12Q9H4Q4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms