Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms