Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms