Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BPESC1Q9GZL8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BPESC1Q9GZL8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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