Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms