Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZYG11BQ9C0D3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZYG11BQ9C0D3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms