Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2OQ9C0C9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms