Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SETD2Q9BYW2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms