Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms