Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM42Q9BTD8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms