Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms