Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
LPIN3Q9BQK8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms