Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms