Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTAGE1Q96RT6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTAGE1Q96RT6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms