Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARXQ96QS3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms