Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms