Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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