Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms