Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms