Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms