Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms