Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms