Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC39Q96DD0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms