Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms