Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SEMA4DQ92854 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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