Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms