Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms