Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms