Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms