Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms