Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms