Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms