Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP4Q8N2S1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms