Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROM2Q8N271 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROM2Q8N271 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROM2Q8N271 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROM2Q8N271 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PROM2Q8N271 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROM2Q8N271 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROM2Q8N271 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROM2Q8N271 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROM2Q8N271 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROM2Q8N271 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PROM2Q8N271 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PROM2Q8N271 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROM2Q8N271 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROM2Q8N271 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROM2Q8N271 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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PROM2Q8N271 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PROM2Q8N271 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
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