Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms