Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMYD4Q8IYR2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms