Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms