Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z494

NPHP3, Nephrocystin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3Q7Z494 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NPHP3Q7Z494 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPHP3Q7Z494 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms