Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT27Q7Z3Y8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT27Q7Z3Y8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT27Q7Z3Y8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT27Q7Z3Y8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms