Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HS2ST1Q7LGA3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms