Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP34Q70CQ2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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USP34Q70CQ2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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USP34Q70CQ2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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USP34Q70CQ2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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USP34Q70CQ2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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USP34Q70CQ2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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USP34Q70CQ2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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USP34Q70CQ2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP34Q70CQ2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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