Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM47EQ6ZV65 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms